Muốn quyết định xử lý ở mức độ nào cần chú ý những vấn đề sau
Căn cứ vào diện tích vùng nước lớn hay nhỏ.
Điều kiện đánh bắt dễ hay khó và khả năng đánh bắt có chủ động khống chế được hay không.
Tính ăn cụ thể của cá tạp đối với từng đối tượng cụ thể trong từng vùng nước cụ thể, hay nói rộng hơn là đặc tính sinh học của chúng.
Tình hình thả cá giống về thành phần, cỡ cá, số lượng, mật độ, mùa vụ thả giống, tốc độ lớn của cá giống sau khi thả.
Tình hình phát triển của các loài cá tự nhiên trong vùng nước.
Mức độ ảnh hưởng của cá tạp đối với các cá con của các loài cá nuôi và cá kinh tế.
Quy luật phát triển của các đối tượng cá tạp trong điều kiện nuôi thả và khai thác thường xuyên.
Giá trị kinh tế của từng đối tượng cá tạp trong vùng nước. Ví dụ như loài Atractosteus spatula (cá cá sấu), trong gần một nửa thế kỷ, chúng được coi là "cá tạp" hay một "loài phiền toái" có hại cho dân chơi câu cá, và do đó mục tiêu cho việc loại bỏ bởi chính quyền bang và liên bang ở Hoa Kỳ. Sau đó chúng đã được bảo vệ.
